Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms