Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms