Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930553M12RikQ9CUH1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms