Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gdpd1Q9CRY7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd1Q9CRY7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms