Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3bpQ9CQ82 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms