Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms