Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcgf6Q99NA9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms