Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PccbQ99MN9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms