Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxp3Q99JB6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxp3Q99JB6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms