Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc33a1Q99J27 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms