Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms