Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCV1

Abhd17c, Protein ABHD17C, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abhd17cQ8VCV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abhd17cQ8VCV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abhd17cQ8VCV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms