Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn4Q8VCH8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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