Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms