Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd1Q8K4M5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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