Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp2Q8CGR7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms