Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc9Q8CDN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms