Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4aQ8BU40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4aQ8BU40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms