Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR90

UPF0600 protein C5orf51 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BR90 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BR90 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8BR90 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8BR90 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8BR90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8BR90 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8BR90 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8BR90 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8BR90 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms