Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms