Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pja2Q80U04 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pja2Q80U04 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms