Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scarb1Q61009 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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