Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF3Q5VWG9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms