Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIVEP3Q5T1R4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms