Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf12Q5SPL2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms