Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc114Q3UX62 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms