Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cib3Q0P523 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib3Q0P523 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms