Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms