Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms