Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms