Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms