Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx1P83917 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms