Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8a1P70704 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8a1P70704 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms