Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms