Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcbP68404 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcbP68404 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms