Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm9sf2P58021 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm9sf2P58021 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms