Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCAMP43121 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCAMP43121 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCAMP43121 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCAMP43121 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCAMP43121 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms