Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab23P35288 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms