Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stfa3P35173 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stfa3P35173 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms