Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pabpc1P29341 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms