Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjc1P28229 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjc1P28229 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms