Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2afxP27661 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2afxP27661 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms