Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nid1P10493 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms