Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Schip1P0DPB4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Schip1P0DPB4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms