Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9P06683 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9P06683 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9P06683 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9P06683 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9P06683 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9P06683 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9P06683 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9P06683 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9P06683 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms