Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGAP02671 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGAP02671 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGAP02671 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGAP02671 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGAP02671 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGAP02671 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGAP02671 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGAP02671 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGAP02671 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms