Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt1O88346 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms