Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF3O43395 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF3O43395 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms