Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd2O35927 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd2O35927 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms