Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp100O35892 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp100O35892 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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